政府为了鼓励高新企业发展，特别在税收方面给予了相关的优惠，让高新企业可以不会承担太多的税，进一步拉动高新技术行业的发展，提高国家的软实力。

(一)所得税率优惠。高新企业享受15%的优惠所得税率，相当于在原来25%的基础上降低了40%。

(二)“两免三减半”。原深圳特区以内，2008年1月1日以后成立的企业自取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第一年至第二年免征企业所得税，第三年至第五年按照25%的法定税率减半征收企业所得税。

(三)人才安居。高新技术企业可以每两年推荐一位本公司的深圳高层次人才申请购房补贴，补贴标准为：按上年度深圳商品房均价补助32平米，同时各区政府配套补贴总额的10%(合计70万左右)。

(四)高新技术企业符合条件的技术转让所得免征、减征企业所得税。一个纳税年度内，居民企业技术转让所得不超过500万元的部分，免征企业所得税;超过500万元的部分，减半征收企业所得税。

(五)高新技术企业固定资产加速折旧。允许加速折旧的固定资产包括：1、由于技术进步，产品更新换代较快的固定资产;2、常年处于强震动、高腐蚀状态的固定资产。采取缩短折旧年限方法的，最低折旧年限不得低于本条例第六十条规定折旧年限的60%;采取加速折旧方法的，可以采取双倍余额递减法或者年数总和法。

(六)研发费用加计扣除。企业为开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按照规定据实扣除的基础上，按照研究开发费用的50%加计扣除;形成无形资产的，按照无形资产成本的150%摊销。

(七)取得国家高新技术企业证书后可享受各区相应认定补贴，如：龙华新区20万，宝安，罗湖各10万。

(八)进入高新区股份代办系统进行股份报价转让的高新技术企业，予以最高180万元资助。

(九)高新企业认定是新三板上市的必备条件，优先批准符合上市条件的股份制高新技术企业股票上市。

(十)高新企业认定是申请各级相关政府资金的必备条件之一。

(十一)高新企业可优先获得办公及工业用地的获批。